O detetive novato James Gordon e seu parceiro Harvey Bullock investigam o assassinato de um casal milionário que deixou órfão um menino de 12 anos chamado Bruce Wayne.
Os detetives Gordon e Bullock investigam uma quadrilha de tráfico infantil que tem como alvo as crianças de rua de Gotham, incluindo Selina Kyle.
Os detetives Gordon e Bullock vão à caça de um justiceiro que está matando cidadãos corruptos de Gotham, prendendo-os a balões meteorológicos.
Políticos de todas as inclinações estão em perigo quando se aproxima a votação de um litigioso conselho da cidade sobre o futuro do distrito de Arkham.
Gordon e Bullock buscam nas ruas de Gotham a origem de uma nova droga que causa euforia seguida de morte.
Um assassino tem como alvo os primogênitos da elite de Gotham, forçando Bullock a confrontar lembranças traumáticas de um caso parecido que ele investigou no passado.
O Pinguim revela um novo elemento de sua estratégia manipuladora, forçando Gordon a encarar as consequências de sua decisão de poupar a vida do vilão.
Gordon e Bullock investigam o assasinato de um cidadão de Gotham espancado até a morte, enquanto Bruce volta às aulas e tem dificuldades em fazer amigos.
Tentando fechar o caso do assassinato do casal Wayne, o jovem Harvey Dent estimula o Gordon a se unir ao prefeito James.
Após um tropeço, Gordon é transferido e começa a trabalhar no Arkham Asylum, enquanto Selina foge de assassinos em Gotham junto com um novo amigo.
Gordon tem um início conturbado no Asilo Arkham, quando o assassinato de um guarda e sua investigação o levam a conhecer a Dra. Leslie Thompkins.
Em uma tentativa de conseguir seu emprego de volta, Gordon busca capturar Jack Gruber, um gênio demente que escapou do Asilo Arkham.
Quando a principal testemunha de um homicídio é morta ao ser detida pela polícia, Gordon suspeita que seja um trabalho interno e pede ajuda a um velho amigo.
Fish Mooney revela um segredo de Oswald Cobblepot, levando Maroni a testar sua lealdade. Enquanto isso, Gordon e Bullock caçam um assassino de pessoas com fobias severas.
Gordon e Bullock tentam capturar Gerald Crane, um professor de biologia que está assasinando e colhendo as glândulas de suas vítimas.
Gordon leva a Dra. Leslie Thompkins ao circo, mas o passeio se transforma quando o circo sofre um ataque.
Gordon e Bullock investigam a gangue do Capuz Vermelho após diversos roubos a bancos.
Enquanto Gordon busca informações sobre a recente controvérsia envolvendo o Comissário Loeb, a aliança de Fish é questionada quando ela junta forças com o Dr. Dulmacher.
Gordon e Bullock investigam um caso antigo envolvendo um assassino serial de mulheres jovens da cidade de Gotham.
Gordon e Bullock continuam a investigar o Ogro, que quer atingir alguém próximo a Gordon.
Gordon e Bullock tentam encontrar o Ogro, enquanto o Pinguim lidera um massacre que dá início a uma guerra épica.
Quando a guerra entre as gangues de Gotham pega fogo, Fish Mooney bate de frente com Maroni e o Pinguim, tentando reivindicar o seu domínio sobre a cidade.
Enquanto Bruce descobre mais sobre os segredos do seu pai, Gordon reluta ao formar uma parceria com Oswald Cobblepot.
Gordon lidera a missão de encontrar os fugitivos de Arkham. Alfred toma medidas drásticas para proteger Bruce.
Alfred convence Bruce a participar de um evento beneficente que provoca uma situação preocupante.
Uma tragédia faz Gordon ser promovido e reacende nele o compromisso de combate ao crime.
A criminalidade aumenta ainda mais em Gotham quando Pinguim e Galavan se unem a uma família de incendiários.
Bridgit tenta clarear as ideias e ponderar suas opções. Pinguim e Galavam continuam sua busca pelo poder.
Pinguim está decidido a libertar sua mãe e efetuar sua vingança.
Depois que Barbara acorda de um pesadelo sinistro, Galavan faz uma oferta irrecusável a Bruce.
Lee demonstra preocupação com o lado sombrio de Gordon. Edward cuida de Pinguim e lhe pede um conselho.
Selina e Bruce renovam sua parceria. Gordon retoma sua missão de manter Galavan atrás das grades.
Quando Bruce Wayne é raptado, Gordon precisa contar com a ajuda de perigosos aliados.
Gordon se prepara para um importante depoimento. Um novo vilão está congelando as pessoas em Gotham.
Alfred tem novas informações sobre o homem que matou os pais de Bruce
Hugo Strange continua a trabalhar para “curar” a agressividade de Pinguim.
Gordon e Bullock investigam um rastro de pistas deixadas em um roubo no museu, que, sem o conhecimento deles, foram deixadas por Nygma em um perigoso jogo de gato e rato.
Gordon começa a enfrentar novas ameaças e perigos dentro dos muros da prisão. Para sobreviver, ele deve contar com um novo amigo.
Em uma tentativa de limpar seu nome, Gordon rouba o arquivo com seu caso e pede ajuda a Nygma.
Depois de deixar Arkham, Barbara tenta fazer as pazes com Gordon. Depois, Bruce e Alfred rastreiam um dos antigos amigos de Thomas Wayne.
Gordon e Bruce questionam o Professor Strange sobre o Projeto Quimera, o que leva Strange a enviar o recém-ressuscitado Galavan para enfrentar Gordon.
Azrael está à solta, o que provoca a sede de vingança de Pinguim.
Hugo Strange ressuscita Fish Mooney; e Bruce se alia a Gordon, Alfred e Lucius depois de descobrir que um amigo está em perigo.
Enquanto Gordon, Bruce e Lucius permanecem em Indian Hill, a cidade de Gotham recebe uma nova ameaça.
Gordon vai para as ruas de Gotham como caçador de recompensa para encontrar o perverso Hugo Strange e sua capanga ressuscitada Fish Mooney.
O professor Strange continua foragido, mas Fish está à sua caça. Enquanto isso, Gordon e a jornalista Valerie Vale procuram por Fish.
Recém-chegado a Gotham, Jervis Tetch, o Chapeleiro Louco, contrata Gordon para encontrar a sua irmã. O Pinguim se prepara para concorrer à Prefeitura.
O Pinguim está prestes a se tornar o prefeito. Bruce Wayne e Alfred vasculham a cidade em busca do sósia que assumiu a identidade de Bruce.
Bruce Wayne procura Ivy. Recém-eleito prefeito, Cobblepot enfrenta a cobrança do cumprimento das promessas de campanha e um nível de crimes sem precedentes.
Sádico, o Chapeleiro Louco obriga Gordon a fazer uma escolha dramática. Fã de charadas, Edward “Ed” Nygma reencontra um rosto do seu passado.
Após lutar com o Chapeleiro Louco, Gordon embarca em uma viagem psicodélica enlouquecedora. O Pinguim não engole o relacionamento entre Nygma e Isabella.
Cada vez mais alterado, Barnes avança rumo à insanidade. Nygma sofre com sua relação com Isabella. Falcone oferece uma festa de noivado para Lee e Mario.
Gordon pede para Bullock investigar Barnes com urgência. Chocado, Nygma pede ajuda a Pinguim ao receber péssimas notícias. Ivy revela a verdade para Bruce e Selina.
Para evitar uma guerra no submundo de Gotham, Gordon tenta deter uma ameaça contra Mario. Bruce descobre um segredo envolvendo a Corte das Corujas.
O vírus começa a se espalhar pela cidade e o laboratório de Gotham fica cada mais longe de encontrar a cura. Gordon e Mario se enfrentam antes do casamento.
Gordon e Bullock descobrem um plano de ressuscitar um criminoso impiedoso. Selina encara o retorno de sua mãe à Gotham. O Pinguim vai à TV no horário nobre.
Ao anunciar a volta de Jerome do mundo dos mortos, Dwight leva os seguidores do criminoso à loucura.
Jerome sai em busca de Bruce. O tio de Gordon faz uma visita inesperada. E o Pinguim e Nygma se enfrentam cara a cara.
Gotham descobre um novo vilão quando Nygma apresenta o “Charada”. Gordon fica sabendo de detalhes chocantes sobre a morte de seu pai.
Uma arma terrível ameaça a cidade. Bruce Wayne começa seu treinamento no templo. E Gordon descobre mais segredos do passado da família.
Enquanto o Charada avança sobre a cidade, o Pinguim reúne alguns dos vilões mais temidos de Gotham, incluindo o Senhor Frio.
Gordon faz descobertas assustadoras e pressiona Kathryn por um lugar à mesa da Corte das Corujas. Bruce Wayne intensifica seu treinamento.
Gordon e Bullock fazem uma descoberta sobre segredos do submundo de Gotham. Bruce fica sabendo de sua real missão. O Pinguim e o Charada têm de trabalhar juntos.
Os vilões mais sinistros da cidade juntam forças, e Gotham enfrenta a ameaça de um vírus destruidor. O jovem Bruce tem de encarar o seu destino.
Com o vírus mortal se espalhando por toda a cidade, a busca pelo antídoto continua, enquanto Fish Mooney, O Charada e O Pinguim revelam seus próprios planos.
Gordon teme que Jonathan Crane ainda esteja vivo e de volta a Gotham, quando o modus operandi do Espantalho aparece em uma série de assaltos.
Sob pressão para provar que a Polícia de Gotham ainda é poderosa, Gordon tenta prender Jonathan Crane. No entanto, Gordon se coloca em uma situação perigosa em Arkham quando é forçado a lutar contra lunáticos e o demônio dentro de si mesmo.
Gordon viaja para Miami na tentativa de persuadir Carmine Falcone a ajudar na luta contra o Pinguim. Lá, ele conhece a filha de Carmine, Sofia, que acompanha Gordon de volta a Gotham.
Bruce Wayne coloca as vidas do historiador do Museu de História Natural de Gotham, Niles Winthrop, e seu neto, Alex, em perigo em uma tentativa de descobrir o significado por trás da valiosa faca do leilão.
Nygma fica cara a cara com Butch Gilzean, mas ele não é quem costumava ser. Na tentativa de recuperar o poder e a identidade, Nygma decide colocar as habilidades de seu ex-parceiro à prova.
Gordon e Bullock perseguem um serial killer que está assassinando policiais e colocando suas vítimas junto a cabeças cortadas de porcos.
Com o Professor Pyg provocando o medo em Gotham, Gordon e Bullock vão para Narrows em busca de pistas. Bruce Wayne encontra uma antiga amiga, Grace, que o convence a ir para uma noite com velhos colegas de classe.
Grundy e Nygma tornam-se as atrações principais no Cherry’s Place em Narrows. Pinguim quer vingança quando ouve Nygma zombando dele no palco e recruta as Sereias para ajudar.
Professor Pyg continua a atormentar a cidade de Gotham, envolvendo Jim Gordon sempre que possível. Sofia e Pinguim se preparam para um evento de arrecadação de fundos para o orfanato, mas as coisas não vão como planejado quando o Professor Pyg aparece como o chef.
Gordon tenta negociar um acordo com o Pinguim que envolve Sofia. Enquanto isso, Alfred tenta tirar Bruce de sua rebeldia adolescente. E Lee Thompkins ganha mais controle sobre Narrows.
As coisas se complicam para Gordon, Sophia e Pinguim quando Carmine Falcone vem para a cidade.
Gordon é chamado quando o Toy Maker é contratado para assassinar um dos médicos de Gotham. Lee Thompkins começa a tentar reconstruir o Narrows, com Nygma como seu parceiro.
Ivy rastreia um projeto secreto no qual a Wayne Enterprises está trabalhando e começa a perseguir qualquer pessoa que possa dar informações.
Ivy escolhe seu próximo alvo, levando Gordon e Lucius de volta a um velho amigo, enquanto Selina tenta resolver o problema com suas próprias mãos. Sofia quer o controle total de Gotham e procura Lee para tratar de Narrows.
Bullock e Gordon tentam rastrear alguém que é fundamental para o controle de Sofia sobre Gotham.
A “elite” de Arkham dá trabalho para Gordon e Bullock, enquanto os criminosos planejam escapar do asilo.
Gordon e Bullock tentam ficar um passo à frente quando Jerome se aproxima do seu próximo alvo.
Os prisioneiros de Arkham ainda estão livres pela cidade e ficando cada vez mais difíceis de capturar. Gordon desenvolve um plano, mas tem que procurar a ajuda de Bruce, mesmo que relutantemente.
Gordon e Bullock tentam descobrir quem é o esperto ladrão por trás dos vários roubos de banco em Gotham; Barbara é colocada em perigo, forçando Tabitha a pedir ajuda.
O caos se instaura no Departamento de Polícia de Gotham, forçando Gordon a procurar o culpado por trás disso; um amigo de Bruce fica paranoico, deixando-o com um comportamento perigoso.
Gotham cai em completa anarquia, então uma equipe de heróis improváveis se aproxima para salvá-la. Bullock assume cargo de lideranç. Os limites psicológicos de Bruce são testados quando pessoas próximas a ele são colocadas em perigo.
No último episódio da temporada, Jeremiah alerta Gordon sobre a destruição que está por vir. Enquanto isso, Barbara reúne uma equipe e Bruce se entende com o futuro.
Uma Gotham mergulhada no caos atrai antigos vilões. Gordon e Bruce lutam para manter a cidade segura. Selina enfrenta a incerteza do futuro.
Bruce vai atrás de uma suposta bruxa. Gordon e Bullock seguem uma pista até uma fábrica cheia de crianças desaparecidas. Nygma encara seus demônios.
Os refugiados estavam em um local seguro de Gotham, até Pinguim aparecer para buscar seu pessoal. Selina está decidida a encontrar Jeremiah e pede ajuda a Bruce.
Após um ataque explosivo, Pinguim oferece ajuda a Gordon. Lucius e Nygma chegam a um acordo. Selina faz uma busca mais direcionada.
Numa tentativa de restaurar a ordem, Gotham sofre uma intervenção militar. A busca de Nygma por respostas o leva até Pinguim e o faz reencontrar Hugo Strange.
Numa guerra de alianças improváveis, Gordon reúne uma equipe para recuperar o controle de Gotham. Uma vilã nova e astuta deixa Pinguim e Selina em alerta.
Gordon corre contra o tempo para encontrar o criminoso que ameaça a reunificação de Gotham. Um conhecido vilão retorna com a ajuda do Chapeleiro Maluco.
Um vilão que muda de forma e tem como alvo os policiais de Gotham conecta Bullock a fantasmas de seu passado. Bruce e Alfred vasculham os esgotos da cidade.
Ferido, Gordon cai em sono profundo e tem um sonho febril onde é julgado por uma série de erros. Ivy está de volta e tem em Bruce o seu alvo.
Bruce e Gordon ficam cara a cara com Eduardo, que passou por uma grande transformação. Prestes a dar à luz, Barbara pede ajuda a Lee.
Bane e Nyssa apertam o cerco, e Gordon recorre a velhos inimigos para tentar salvar a cidade. Uma decisão importante muda o destino de Bruce.
Dez anos após ter deixado Gotham, Bruce retorna para a inauguração da Torre Wayne e encontra uma cidade sombria que precisa de um cavaleiro.